Jp/ComplexRI
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| Index |
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| 概要 |
| 作成の沿革 |
| チュートリアル |
| マニュアル |
| 理論 |
| よくある質問 |
概要
複素屈折率は光と物質の相互作用に関する研究と分光分析において基本的な性質です。特に、和周波発生分光に関する研究における和周波スペクトルの解析のために、典型的な3層界面モデルにおけるフレネル係数の詳細な情報が必要になり、これは液体中の複素屈折率に影響を受けています。先行研究[1]では、フレネル係数の分散が重要であり、和周波発生スペクトルの解析結果を大きく変える可能性があることを示しました。しかしながら、和周波発生分光研究でよく使われる液体の赤外領域の複素屈折率がほとんど明らかにされていません。したがって、私たちは、ATR-IRスペクトルのデータをつかって、液体の複素屈折率を得ることができるソフトウェアComplexRIを開発しました。ComplexRIの出力は赤外領域での複素屈折率です。ユーザーは解析対象の振動数領域を指定することができます。
作成の沿革
開発は東北大学の計算分子科学研究室で行われました。
2019年、王が主要なプログラムコードを開発しました。電極/電解質界面におけるフレネル係数の分散について研究しており、その経緯からこのコードを開発しました。[1]2020年には村田と王がコードを大幅に拡張し、さらに、和周波発生分光の研究でよく使われる20種類の液体についての複素屈折率のデータベースを作り上げました。[2]王はこのデータベースを使い、和周波発生スペクトルの解析におけるフレネル係数の分散の一般的な影響について議論しました[3]。2021年には、王と森田の指導の下で、上村によってプログラムコードが要約され、Webサイトに公開されました。自動フィッティングの手順が更新されました。上村と王はComplexRIのMediaWikiのマニュアルの作成も行いました。
開発に協力してくださった実験家の皆様には心から感謝申し上げます。
- 二本柳 聡史研究員 (理研)、 井上 賢一助教 (東北大学)、 叶 深教授(東北大学)、 田原 太平研究員 (理研)。
チュートリアル
| 使用例 |
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| チュートリアル01： Automatic Mode |
| チュートリアル02： Manual Mode |
マニュアル
| 入力 |
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| Information of ATR-IR experiment |
| Control parameters of ComplexRI fitting |
| 出力 |
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| 標準出力 |
| 結果のダウンロード |
理論
| Calculated reflectance of ATR-IR from complex refractive index |
| How to Fit the ATR-IR spectra |
| Automatically determine the initial parameters in fitting procedure |
よくある質問
- ComplexRIが役に立つと感じた方は、以下の参考文献を引用していただきたく思います。
- ↑ 1.0 1.1 "Effect of Frequency-Dependent Fresnel Factor on the Vibrational Sum Frequency Generation Spectra for Liquid/Solid Interfaces" Lin Wang, Satoshi Nihonyanagi, Ken-ichi Inoue, Kei Nishikawa, Akihiro Morita, Shen Ye, Tahei Tahara, J. Phys. Chem. C, 123(25) 15665-15673 (2019).
- ↑ "Dispersion of Complex Refractive Indices for Intense Vibrational Bands. I Quantitative Spectra" Ryo Murata, Ken-ichi Inoue, Lin Wang, Shen Ye, and Akihiro Morita, J. Phys. Chem. B, 125(34), 9794-9803 (2021).
- ↑ "Dispersion of Complex Refractive Indices for Intense Vibrational Bands. II Implication to Sum Frequency Generation Spectroscopy" Lin Wang, Ryo Murata, Ken-ichi Inoue, Shen Ye, and Akihiro Morita, J. Phys. Chem. B, 125(34), 9804-9810 (2021).