「En/ComplexRI」の版間の差分

提供: ComplexRI: Manual
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__NOTOC__
{|class="wikitable"
! Index
|-
|[[#Overview|Overview]]
|-
|[[#Characteristic|Characteristic]]
|-
|[[#Production|Production]]
|-
|[[#Tutorial|Tutorial]]
|-
|[[#Manual|Manual]]
|-
|[[#Internal processing|Internal processing]]
|}
== Overview ==
: The complex refractive index is a basic property in the study of light-matter interactions and spectroscopy. Especially in the sum frequency generation (SFG) vibrational spectroscopy studies, the analysis of SFG spectra requires detailed information of the Fresnel factors in the typical three-layer interface model. The dispersion of Fresnel factors in SFG spectra originates from the complex refractive index of the liquid. Studies <ref name = "ref1" /> have shown that the dispersion of the Fresnel factor may become significant and seriously change the analysis results of SFG spectra. However, the complex refractive index in the Infrared region is somehow unavailable for most commonly used liquids in SFG studies. Therefore, we have developed ComplexRI software package to obtain the complex refractive index of any liquids by using the ATR-IR spectra.
==Characteristic==
*全反射実験の実験データさえあれば、複素屈折率の分散を出すことが可能。
*適用範囲は赤外領域。これは、和周波分光では官能基を調べることを目的としており、これに一致する光の周波数帯が赤外領域だからである。
==Production==
　和周波分光の結果をより正確に解析するための情報として様々な官能基に関する複素屈折率の分散を調べた論文<ref name = "ref1" /><ref name = "ref2" /><ref name = "ref3" />がある。これは全反射実験のデータに基づいて屈折率の分散をまとめたものになっている。本ComplexRIはこれに基づいて、全反射実験のデータさえ与えれば、同じようなフィッティングが簡単に行えるように開発された。<br />
　フィッティング計算には論文<ref name = "ref2" /><ref name = "ref3" />で用いられたものを主として用いている。これは、本研究室の王助教と以前森田グループに所属していた村田によって作成されたものである。本ComplexRIでは初期値を設定しなくてもフィッティングが行えるように、少しアルゴリズムを改良している。これは本研究室の森田教授、王助教の指導の下で上村が実装した。<br />
　また、WebアプリケーションとしてのUIも上村が実装した。
== Tutorial ==
{|class="wikitable"
! Examples to use ComplexRI
|-
|[[Tutorial01|Tutorial01]]： Automatic Mode
|-
|[[Tutorial02|Tutorial02]]： Manual Mode
|}
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==Manual==
==Manual==
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==Internal processing==
== Tutorial ==
 
{|class="wikitable"
{|class="wikitable"
! index（Internal peocessing）
! Examples to use ComplexRI
|-
| Tutorial01：[[Tutorial01| Automatic Mode]]
|-
|-
|[[explanation01|explanation01]]：How to fit the Reflectance spectra
| Tutorial02： [[Tutorial02|Manual Mode]]
|}
|}
<span style="font-size: 100%; color:red;">※We recommend you to use chrome browsers to read this page. In some browser, it may take long time to open this page.</span>


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==Theory==


{|class="wikitable"
|-
|[[Theory#ATR-IR data|Calculated reflectance of ATR-IR from complex refractive index]]
|-
|[[Theory#Fitting procedure| How to Fit the ATR-IR spectra]]
|-
|[[Theory#Auto Fitting|Automatically determine the initial parameters in fitting procedure]]
|}


[http://comp.chem.tohoku.ac.jp/mediawiki/index.php/en/ComplexRI Top of this page]]
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==References==
[http://comp.chem.tohoku.ac.jp/mediawiki/index.php/en/ComplexRI Top of this page]
<references>
<ref name = "ref1">"Effect of Frequency-Dependent Fresnel Factor on the Vibrational Sum Frequency Generation Spectra for Liquid/Solid Interfaces"
Lin Wang, Satoshi Nihonyanagi, Ken-ichi Inoue, Kei Nishikawa, Akihiro Morita, Shen Ye, Tahei Tahara, J. Phys. Chem. C, 123(25) 15665-15673 (2019).</ref>
<ref name = "ref2">"Dispersion of Complex Refractive Indices for Intense Vibrational Bands. II Implication to Sum Frequency Generation Spectroscopy"
Lin Wang, Ryo Murata, Ken-ichi Inoue, Shen Ye, and Akihiro Morita, J. Phys. Chem. B, 125(34), 9804-9810 (2021).</ref>
<ref name = "ref3">"Dispersion of Complex Refractive Indices for Intense Vibrational Bands. I Quantitative Spectra"
Ryo Murata, Ken-ichi Inoue, Lin Wang, Shen Ye, and Akihiro Morita, J. Phys. Chem. B, 125(34), 9794-9803 (2021).</ref>
</references>

2022年2月14日 (月) 01:54時点における最新版

Manual

Input of ComplexRI
Information of ATR-IR experiment
Control parameters of ComplexRI fitting
Output of ComplexRI
Stardard output of ComplexRI
Download your results

Tutorial

Examples to use ComplexRI
Tutorial01： Automatic Mode
Tutorial02： Manual Mode

Theory

Calculated reflectance of ATR-IR from complex refractive index
How to Fit the ATR-IR spectra
Automatically determine the initial parameters in fitting procedure

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