利用者の投稿記録
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- 2026年5月26日 (火) 02:40 差分 履歴 +1,433 新 Tools/therm int.exe ページの作成:「分子の一般化座標を拘束したMPI並列計算による平均力サンプリングの出力ファイルを読み込み、 1次元自由エネルギー面を計算…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:39 差分 履歴 +1,369 新 Tools/tapstep fit.exe ページの作成:「一次元自由エネルギー面をバイアスポテンシャルのタイプTAPERED_STEPでフィッティングするプログラム。 主にグランドカノニカ…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:39 差分 履歴 +4,579 新 Tools/gc analyzer.exe ページの作成:「グランドカノニカルMDの出力データを解析し、ON-OFF間の密度分布と自由エネルギー面を求めるプログラム。 それぞれFreeFlex.exe…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:39 差分 履歴 +3,738 新 Tools/analysis.exe ページの作成:「 monitor システムによって出力されたデータファイルを解析するためのプログラム。 平均値、分布関数、時間相関関数、自由エ…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:38 差分 履歴 +3,475 新 チュートリアル12:導体モデルを用いた固液界面のMD計算 ページの作成:「導体分子を含む系のMD計算を行うためのチュートリアル。 導体計算のプログラム内部での取り扱いの概要と、実際の MD 計算に…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:37 差分 履歴 +16,921 新 チュートリアル11:界面張力計算 ページの作成:「界面張力の計算を行う時、平衡化については他の方法と同様である。従ってここでは、サンプリング(インプットとしてどの変…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:37 差分 履歴 +42,912 新 (水溶液界面のグランドカノニカルMD) ページの作成:「溶液の界面の系を適用対象として液相のバルクにおける溶質密度を一定とするグランドカノニカルMDの実行方法、特にCoulomb相…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:37 差分 履歴 +33,377 新 チュートリアル10:溶液界面のグランドカノニカルMD ページの作成:「溶液の界面の系を適用対象として液相のバルクにおける溶質密度を一定とするグランドカノニカルMDの実行方法を解説する。…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:36 差分 履歴 +14,575 新 チュートリアル09:ガウス関数を用いた自由エネルギー面のフィッティング ページの作成:「任意次元の自由エネルギー面の離散的な計算値を、なめらかな解析関数でフィッティングする。 == 計算の基礎 == 任意次元の…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:36 差分 履歴 +8,013 新 チュートリアル08:water finger の解析と2次元自由エネルギー面の計算 ページの作成:「本章ではwater finger の解析と2次元自由エネルギー面の計算について説明する。 == 計算する系の作成 == チュートリアル07:REUS…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:36 差分 履歴 +9,475 新 チュートリアル07:REUSを用いた1次元自由エネルギー面の計算 ページの作成:「 本章ではREUS(レプリカ交換アンブレラサンプリング)を用いた1次元自由エネルギー面の計算を説明する。 == 計算する系の作…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:35 差分 履歴 +5,690 新 チュートリアル06:ランダム力の時間相関関数 ページの作成:「 本節ではFreeFlexを用いたランダム力の時間相関関数の計算方法を示す。 今回は、水900 分子、Cl<sup>-</sup>イオン1分子の系で…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:35 差分 履歴 +1,287 新 (チュートリアル05:拘束計算) ページの作成:「 FreeFlex で拘束計算を行うにはネームリストファイルに、 === input.nml ===========================================================================…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:35 差分 履歴 +19,332 新 チュートリアル04:自由エネルギー摂動計算 ページの作成:「 ここでは、水分子1つがDCM液体に加わった/消えたときの自由エネルギー差として、溶媒和自由エネルギーを求める。実際の計…」
- 2026年5月26日 (火) 02:35 差分 履歴 +15,789 新 チュートリアル03:water finger の解析 ページの作成:「 本章ではFreeFlexによるwater finger の解析について説明する。 系としては 水-DCM系における Na<sup>+</sup> の輸送を取り扱う。 '''注…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:34 差分 履歴 +13,256 新 チュートリアル02：並列実行 ページの作成:「 本章ではFreeFlexにより同時に複数のMD計算を行う方法について説明する。なお、MPI計算はサーバーごとに使用方法が微妙に異…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:34 差分 履歴 +20,549 新 チュートリアル01：水-DCM 界面のシミュレーション ページの作成:「 本章ではFreeFlexを用いたMD計算の実行までを説明する。 == FreeFlex のビルド == FreeFlex には 2026/03/16 現在、 FreeFlex/Makefile、Fre…」 最新
- 2026年5月26日 (火) 02:22 差分 履歴 +59,617 新 数式の書き方 ページの作成:「Original Link: [https://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%88%A9%E7%94%A8%E8%80%85:%E3%82%8F%E3%81%9F%E3%81%82%E3%82%81%E3%81%B2%E3%81%BF%E3%81%A4/%E6%95%B0%E5%BC%8F%E3%81%AE%E6%9…」 最新
- 2026年5月25日 (月) 16:53 差分 履歴 +12,777 Private:FreeFlex マニュアル
- 2026年5月25日 (月) 16:51 差分 履歴 +635 MediaWiki:Sidebar 最新
- 2026年5月25日 (月) 16:44 差分 履歴 +34 Private:FreeFlex マニュアル →FreeFlex Manual: 新しい節
- 2026年5月25日 (月) 16:41 差分 履歴 +36 新 MediaWiki:FreeFlex マニュアル Hirano がページ「MediaWiki:FreeFlex マニュアル」を「FreeFlex マニュアル」に、リダイレクトを残して移動しました 最新 タグ: 新規リダイレクト
- 2026年5月25日 (月) 16:41 差分 履歴 0 細 Private:FreeFlex マニュアル Hirano がページ「MediaWiki:FreeFlex マニュアル」を「FreeFlex マニュアル」に、リダイレクトを残して移動しました
- 2026年5月25日 (月) 16:36 差分 履歴 0 細 Private:FreeFlex マニュアル Hirano がページ「FreeFlex マニュアル」を「MediaWiki:FreeFlex マニュアル」に移動しました
- 2026年5月25日 (月) 16:34 差分 履歴 +9 新 Private:FreeFlex マニュアル ページの作成:「テスト」