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2026年5月26日 (火) 04:40 差分履歴 0‎ 細テンプレート:NumBlk/doc ‎ 1版をインポートしました最新
2026年5月26日 (火) 04:35 差分履歴 +296‎ 新テンプレート:EquationNote ‎ ページの作成:「'''{{#if:{{{2|}}}|{{{2}}}|{{{1}}}}}'''<noinclude>{{documentation|content= See Template:EquationRef for documentation. Note that th…」
2026年5月26日 (火) 04:33 差分履歴 +19,894‎ 新テンプレート:NumBlk/doc ‎ ページの作成:「{{Documentation subpage|種類=テンプレート}} <!--{{翻訳中途|1=[http://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Template:NumBlk/doc&oldid=…」
2026年5月26日 (火) 04:25 差分履歴 +86‎ 新 Tools/z dist.exe ‎ ページの作成:「z方向の分布関数を求めるプログラム。汎用化はされていない。」最新
2026年5月26日 (火) 04:25 差分履歴 +109‎ 新 Tools/watnumdist.exe ‎ ページの作成:「イオン周りの水分子数の分布関数を作成するプログラム。汎用化されていない。」最新
2026年5月26日 (火) 04:25 差分履歴 +229‎ 新 Tools/show energy.exe ‎ ページの作成:「FreeFlex のログファイルから各種エネルギーの変化のグラフを作成するプログラム。使い方: ./show_energy.exe log ndata *log: ログ…」最新
2026年5月26日 (火) 04:24 差分履歴 +629‎ 新 Tools/search traj.exe ‎ ページの作成:「トラジェクトリ情報が記載されたxyzファイルから特定の構造を取り出すプログラム。取り出す構造はプログラム中の #define KEYW…」最新
2026年5月26日 (火) 04:24 差分履歴 +151‎ 新 Tools/fep 2d to 1d.exe ‎ ページの作成:「二次元自由エネルギー曲面を積分し、一次元の自由エネルギー曲線を得るプログラム。汎用化はされていない。」最新
2026年5月26日 (火) 04:24 差分履歴 +130‎ 新 Tools/avarage2d.exe ‎ ページの作成:「イオン周りの水分子数の平均値の二次元マップを作成するプログラム。汎用化はされていない。」最新
2026年5月26日 (火) 04:24 差分履歴 +192‎ 新 Tools/RDF.exe ‎ ページの作成:「RDF を計算するプログラム。聆鉴君が作成。ネームリストによる汎用化されている。簡単な使い方のチュートリアルを作って…」最新
2026年5月26日 (火) 04:23 差分履歴 +168‎ 新 Tools/FEPSHOW.exe ‎ ページの作成:「tools/FEPSHOW.exe: ２つの状態間の自由エネルギー差を求めるプログラム。チュートリアル04:自由エネルギー摂動計算を参照。」最新
2026年5月26日 (火) 04:23 差分履歴 +572‎ 新 Old/unlap.exe ‎ ページの作成:「msファイルの分子の重なりを除去するプログラム。初期構造の緩和に用いる。同じグループでないサイト間の距離を一定距離…」最新
2026年5月26日 (火) 04:23 差分履歴 +147‎ 新 Xyz2ms.exe ‎ ページの作成:「msファイル中の座標をxyzファイルの座標で上書きするプログラム。使い方: ./xyz2ms.exe input.xyz input.ms output.ms」最新
2026年5月26日 (火) 04:22 差分履歴 +239‎ 新 Wham.exe ‎ ページの作成:「WHAM 計算を行うプログラム。古いバイアス・ポテンシャル（bias_struct）に対して作成されているため新しいバイアス・ポテンシ…」最新
2026年5月26日 (火) 04:22 差分履歴 +113‎ 新 Ms2xyz.exe ‎ ページの作成:「msファイルをxyzファイルに変換するプログラム。使い方: ./ms2xyz.exe input.ms output.xyz」最新
2026年5月26日 (火) 04:22 差分履歴 +231‎ 新 Gauss fit.exe ‎ ページの作成:「WHAMで計算した自由エネルギー面を、多数のガウス関数でフィッティングするプログラム。使い方:./gauss_fit.exe input.nml *input.nml…」最新
2026年5月26日 (火) 04:22 差分履歴 +247‎ 新 Add.exe ‎ ページの作成:「初期構造作成のためのプログラム。現行版はadd2.exeである。使い方:./add2.exe input.nml output.ms *input.nml: &system 及び &add ネームリ…」最新
2026年5月26日 (火) 04:21 差分履歴 +182‎ 新 FreeFlex.exe ‎ ページの作成:「MD計算を行うプログラム。使い方: ./FreeFlex.exe input.nml *input.nml: &FreeFlex及びその他各種アドイン等のネームリストを記載したフ…」最新
2026年5月26日 (火) 04:21 差分履歴 +2,538‎ 新拡張構造体を使ったプログラミングにおける問題と解決策 ‎ ページの作成:「Fortran で拡張構造体を利用する場合、言語仕様に伴ういくつかの困難が存在する。本ページではそれらについて示すとともに…」最新
2026年5月26日 (火) 04:21 差分履歴 +3,647‎ 新（旧）各種ドキュメントの説明 ‎ ページの作成:「== 各種ドキュメントの説明 == ;analysis.docx: anlysis.exe に関する説明。 ;bias.nb:電場を制御したMDで使用するバイアス関数を考察す…」最新
2026年5月26日 (火) 04:21 差分履歴 +6,737‎ 新 Git簡易マニュアル ‎ ページの作成:「　gitはプログラム開発の過程のバージョン管理を自動化するツールで、ネットワーク上で複数人でのプログラム開発を行う上…」最新
2026年5月26日 (火) 04:20 差分履歴 +5,903‎ 新コーディングルール ‎ ページの作成:「　複数人でプログラム開発を行うときには、ソースコード全体の統一を保って読みやすく管理しやすくするため、一定の共通…」最新
2026年5月26日 (火) 04:20 差分履歴 +2,016‎ 新テンプレート:EquationRef ‎ ページの作成:「<includeonly><span {{#ifeq:{{{noid}}}|noid||id="math_{{{1}}}"}} class="reference nourlexpansion" style="font-weight:bold; font-style:italic;">{{#if: {{{2|}}}|{{{2}}}|{{{1…」
2026年5月26日 (火) 04:20 差分履歴 +15,136‎ 新 Common module ‎ ページの作成:「　commonモジュール(module common_module)内には、プログラム全体で共通性の高い定数や手続きがまとめられている。これらの定数や…」最新
2026年5月26日 (火) 04:19 差分履歴 +3,775‎ 新 Flexlist module ‎ ページの作成:「　Flexiest モジュールは、サイズ可変のリスト型データの集まりのフォーマットを変換するサブルーチンをまとめたものである…」最新
2026年5月26日 (火) 04:19 差分履歴 +1,659‎ 新 LIST DATA ‎ ページの作成:「== Introduction == The list_data_module defined in list_data.F contains an extendable LIST_DATA struct that is used by linked_list_struct and Dicti…」最新
2026年5月26日 (火) 04:19 差分履歴 +16,449‎ 新 Bias system ‎ ページの作成:「== Background == Bias は、ユーザー定義の一般化座標 (一般化座標(ユーザー定義座標) を参照) に対して任意のバイアス・ポテン…」最新
2026年5月26日 (火) 04:19 差分履歴 +6,174‎ 新 Conductor struct ‎ ページの作成:「== 概要 == conductor_struct は導体分子の設定とMD中の分極計算を管理する構造体。 == 変数 == conductor_struct の主な構成変数を以下の…」最新
2026年5月26日 (火) 04:18 差分履歴 +1,030‎ 新 Constraint struct ‎ ページの作成:「== Background == Constraint2 は、分子内の内部座標やユーザー定義の一般化座標 (spcoord_struct を参照) に拘束をかける機能を与える…」最新
2026年5月26日 (火) 04:18 差分履歴 +122‎ 新 Coord struct ‎ ページの作成:「== Background == coord_struct 構造体の解説は、一般化座標(ユーザー定義座標) を参照のこと。」最新
2026年5月26日 (火) 04:18 差分履歴 +16,789‎ 新 System struct ‎ ページの作成:「== 概要 == system_struct は ms ファイルに対する操作を行う構造体である。現在、(ms ファイルの)バージョンが0.3未満と0.3以上で仕…」最新
2026年5月26日 (火) 04:17 差分履歴 +5,953‎ 新 Delaunay triangulation ‎ ページの作成:「This page provides basic information about "delaunay_tri_struct". The "delaunay_tri_struct" contains a subroutine that calculates the Delaunay triangulation from given se…」最新
2026年5月26日 (火) 04:17 差分履歴 +3,044‎ 新 Dictionary data structure ‎ ページの作成:「==Background== The struct that provides user access to dictionary data structure. This dictionary is actually an array of linked lists managed by a simple hash table.…」最新
2026年5月26日 (火) 04:17 差分履歴 +2,932‎ 新 Diis struct ‎ ページの作成:「== 概要 == diis_struct はSCF計算に対する収束加速法であるDIIS法の計算を行う構造体である。 SCF計算は分極計算やWHAM計算等、多く…」最新
2026年5月26日 (火) 04:16 差分履歴 +2,708‎ 新 Fft struct ‎ ページの作成:「 == 概要 == 　プログラムの本体に直接高速フーリエ変換ライブラリの関数を使ってしまうと、ライブラリの移行が困難になる。…」最新

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